Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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LgsnQ8CIX8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LgsnQ8CIX8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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LgsnQ8CIX8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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LgsnQ8CIX8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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LgsnQ8CIX8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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LgsnQ8CIX8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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LgsnQ8CIX8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
LgsnQ8CIX8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms