Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CrebrfQ8CDG5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CrebrfQ8CDG5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms