Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Apoa5Q8C7G5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Apoa5Q8C7G5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms