Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q8C1R3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms