Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Vmn1r11-201ENSMUST00000071304 900 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim35Q8C006 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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