Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10600Q8BQ57 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm10600Q8BQ57 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms