Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Dsg1cQ7TSF0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Dsg1cQ7TSF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms