Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc93Q7TQK5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc93Q7TQK5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms