Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Higd1cQ76I25 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms