Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN9

Rab35, Ras-related protein Rab-35, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab35Q6PHN9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab35Q6PHN9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rab35Q6PHN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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