Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tpm4Q6IRU2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tpm4Q6IRU2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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