Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm5416Q6IE28 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gm5416Q6IE28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5416Q6IE28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5416Q6IE28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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