Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Cep290Q6A078 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Cep290Q6A078 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
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Cep290Q6A078 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cep290Q6A078 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Cep290Q6A078 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Cep290Q6A078 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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