Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Jmjd1cQ69ZK6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Jmjd1cQ69ZK6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms