Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ctnna3Q65CL1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ctnna3Q65CL1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms