Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Usf2Q64705 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Usf2Q64705 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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