Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SypQ62277 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SypQ62277 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SypQ62277 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SypQ62277 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SypQ62277 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SypQ62277 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms