Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Ttf1Q62187 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttf1Q62187 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttf1Q62187 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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