Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sema3cQ62181 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sema3cQ62181 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms