Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tcf12Q61286 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tcf12Q61286 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms