Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Neurod1Q60867 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Neurod1Q60867 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms