Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn2cQ60772 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn2cQ60772 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms