Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sema5bQ60519 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms