Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Specc1Q5SXY1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Specc1Q5SXY1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms