Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms