Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bbs12Q5SUD9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms