Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sco1Q5SUC9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sco1Q5SUC9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms