Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms