Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r223Q5SSA0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms