Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trappc1Q5NCF2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc1Q5NCF2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trappc1Q5NCF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trappc1Q5NCF2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Trappc1Q5NCF2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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