Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ttf2Q5NC05 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttf2Q5NC05 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms