Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Taf3Q5HZG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Taf3Q5HZG4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms