Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prkaa1Q5EG47 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prkaa1Q5EG47 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms