Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rtl5Q5DTT4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rtl5Q5DTT4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms