Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Defa20Q45VN2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Defa20Q45VN2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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