Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1L6

Mtmr11, Myotubularin-related protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr11Q3V1L6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mtmr11Q3V1L6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr11Q3V1L6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms