Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Usp48Q3V0C5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Usp48Q3V0C5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp48Q3V0C5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Usp48Q3V0C5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Usp48Q3V0C5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp48Q3V0C5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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