Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc27Q3V036 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc27Q3V036 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms