Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trim40Q3UWA4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim40Q3UWA4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms