Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Capn13Q3UW68 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms