Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trafd1Q3UDK1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trafd1Q3UDK1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms