Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hectd3Q3U487 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hectd3Q3U487 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hectd3Q3U487 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hectd3Q3U487 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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