Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q3U1D9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q3U1D9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms