Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gtf2f1Q3THK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2f1Q3THK3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms