Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cnn2Q08093 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cnn2Q08093 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms