Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Atf4Q06507 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms