Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sox13Q04891 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sox13Q04891 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms