Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Top1Q04750 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Top1Q04750 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Top1Q04750 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms