Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Smarcad1Q04692 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Smarcad1Q04692 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms