Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Scg2Q03517 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Scg2Q03517 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms